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目标信息素的环化进行的非常顺利,不过徐云并没有因此而产生丝毫松懈。
这间生物医药实验室的使用时间是十四天,虽然明面上来说,课题组只要在这个时间内解决四代吡虫啉的合成就能算成功。
但先前提及过,徐云的终极目标远远不是一个四代这么简单。
这次实验由于需要用到大量设备的缘故,整个项目从立项开始便借用了田良伟辅项项目的名义。
一旦时限完结,届时哪怕是田良伟也很难再给徐云提供这么好的实验条件。
因此这可以说是徐云当前最好的机会,一旦将它错过,轻则拖后第五代吡虫啉的研发,重则可能影响到知识点和时空副本的开启。
所以在对目标信息素完成环化后,徐云等人丝毫没有懈怠,一边继续进行了12小时的搅拌反应。
并于次日凌晨在冰浴冷却下,用饱和NH4Cl水溶液进行了淬灭反应。
到了这一步,剩下的便是将信息素结合蛋白于吡虫啉进行合成的环节了,也是几位生物研究生的主方向。
这个环节通俗点来说就是无限次的碰运气,环化后的信息素结合蛋白好比是一个铁环,为了好理解就假设将它按时钟刻度分成十二格吧。
徐云等人要做的就是拿个小钢珠从上往下丢,由于他们对9到12点钟方向做过了环化处理,所以钢珠的落点必然是9-12之间。
但这个刻度远远不够精细,钢珠只有稳稳的落到46分这个数字上,徐云等人的合成才能算成功——请注意,这只是宏观角度上一个比较好理解的说法,实际上那个圆盘的刻度数字要比12大上无数倍,比如是......
“22440484对!”
实验室内,周佩瑶看着IlluminaHiSeq高通量二代测序平台测序出的数字,平稳的对徐云说道:
“学长,我们通过小分子荧光竞争性结合实验研究了两个OBP与目标信息素的结合能力,一共获得的碱基数据量约为6.6 G,过滤掉原始数据后的读数为22440484。
目标信息素与美洲大蠊样本的基因组比对一致性为84.62 %左右,德国小蠊则为83.68%,结合部读数的理论值为648!”
22440484比648,三万五千分之一的概率,这绝不是一件简单的事儿。
听到这个数字,徐云轻轻点了点头,转而看向裘生:
“老裘,看咱俩的了。”
裘生一拍他肩膀,笑道:
“没啥说的,肝呗,大不了把哥们的这一头秀发都牺牲在这儿嘛。”
说着他表情一肃,拿起一条类似超市小票的纸条看了几眼:
“19.10和19.36kDa,蛋白质电泳条带的位置与预测的分子量一致,小任,直接上荧光竞争结合试验吧。
争取三个小时内把3,11-二甲基正二十七烷-2-酮和目标信息素的结合能力测出来,这样咱们会轻松很多。”
一旁任永存扶了扶眼镜,熟练的将早就准备好的两个试剂结合到了一起。
徐云则站到了在保持通风的超净台内,加入定量好的目标信息素1μg、Anchored Oligo4 μg、2×ESReaction Mix 10μl、gDNARemover 1μl,最后加入RNase-free Water至混合液体积为20 μl。
随后他将20μl混合液轻弹试管混匀,递给周佩瑶:
“小周,设定42 ℃,在PCR仪器中孵化15分钟,然后85°加热5秒。
再把合成的cDNA模板定量,1.2 %琼脂糖凝胶电泳检测合格后储存到零下二十度的环境里。”
周佩瑶接过试管,重重点头:
“您放心吧,学长!”
如果说昨天的环化实验是一篇克苏鲁狗粮文的话,那么今天的合成实验则无疑是个治愈的小故事。
沉睡中,它被唤醒了。
身边的同行催促着它:
“喂喂,该起来了,自从上个周期开始,你就一直没动过呢。”
哦,它想起来了,它是是一个线解聚合酶,还没有遇到它的sigma因子。
虽然前几天才刚过圣诞,但对它来说那不过是一个寻常的夜晚。
他就跟着同伴走啊走,不知过了多久,它的耳边传来一声温柔的呼唤。
“你...好吗?”
它扭过头,看到一个美丽的倩影,亭亭玉立,笑颜如花。
它一时竟然不知道如何回答,只能干巴巴道:
“你...你好呀。”
她太美了,它不敢祈求什么,或许她只是来问最近的启动子在哪儿,那里的聚合酶比它的合成能力可强得多了。
“那个...我是一个Oligo引物,不小心迷路了,能麻烦你给我指个路吗?”
它看着她的眼睛,不假思索地说:
“好呀。”
它绅士地连接起她的结合域,她羞涩地默许了,它们就这样在核基质里散着步,和她一起数着染色体上美丽的条带。
就这样,不知过了多少个周期。
某天,她突然惊喜地摇着它的β钳子:
“你看那儿!”
它朝着她手指的方向望去,那是一条序列:
AUGAUACUCUAGGUGGAGUAUUGAUGA
那不是.....
爱的密码吗?
她一路飞奔过去,轻轻靠在-35序列上,一脸迷醉。
看着这一幕,忽然,它鼓起了勇气:
“那个......你能做我的女朋友吗?”
她的表情忽然愣住了,脸上扬起一丝苦涩:
“我只是一个引物,可能明天就会消亡了,我们的结合是被诅咒的.....”
“一定不会的!我们一定会一直幸福下去!”
它一把抱住她,用力撑开两条紧紧结合的互补链。
她没做太多反抗,于是乎,它们开始了爱情之旅。
一切都很顺利,它看着身后不断延伸的信使链,回头望一望眼中最可爱的她,心中涌动起要保护她一生的冲动。
能得到这样可爱的一位姑娘相伴一生,真是三生有幸!
就这样,又是一段时间过去。
然而某一天,意外出现了。
这个世界的温度忽然开始降低,大量的物质开始凋零、冻结甚至死亡。
它用尽全身力气紧紧的环绕着她,但随着一阵颠簸,它和她结合在一起的结构域突然松动了!
它撕心裂肺地大喊:
“抓紧我,别放开!我会有办法的!”
抖动中传来她无助的回应,带着绝望与哭泣:
“没用的,我做不到!”
一阵环流过后,她离它越来越远。
“把我们的信使链合成完,我永远爱你!”
她小小的身影慢慢淡出它的视线,消失在冰冷的核纤层。
它绝望的仰天大喊,怒叱着命运的不公。
可是该走的路还得走下去,只是现在的它孤身一人了。
它费力地打开粘合着的双链,把一个个核苷酸安放好,每一个碱基都代表了它对她深深的思念。
可是渐渐地,它也感受到了疲惫。
周围的电子不断攻击着它的核心蛋白,它的亚基渐渐松动,最触目惊心的是,它的身后,不知从什么时候起延伸了一条短短的泛素链。
它明白,它的生命即将抵达终点。
弥留之际,它的脑海中闪动着她的笑靥。
原来我一直都这么想念她啊,原来我一直深爱着她。
随后它拖着自己的残躯,就这样缓缓的走啊走,最终来到了一处深坑外。
只见此时此刻,深坑中躺着无数与它相同的聚合酶,从双链上不难看出,他们也都曾遇到过自己的那个她。
它有些费力的挪动到一个角落,目无焦距的看着天空:
“难道说,引物的结合注定没有结果吗?”
朦胧中,他的面前浮现出了她的三维结构,她仿佛正微笑着望着它,向它张开手臂......
就在它的意识即将消散的千分之一个刹那,他的余光中忽然出现了一大一小的两道身影:
那是一个与他身形相似的同类,他的身边并无伴侣,但它的气质一条链上,此时赫然牵着一个精雕玉琢的小女孩。
“那是......那是.....”
他的呼吸骤然急促了起来。
其实不止是他,几乎在一瞬间,由于tio引导效应的缘故,深坑中的每个‘它’都察觉到了来人的身影。
“亲爱的,你看到了吗?!”
它用尽全身最后的一丝力气,就这样笑了起来:
“原来......我们的爱情并没有被诅咒......”
与此同时。
看着RPKM值热土上极小极小的那块红点,徐云不由长输一口气:
“第四代......终于突破了。”